Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb1P28230 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb1P28230 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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