Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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H2-Q1O19441 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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H2-Q1O19441 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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H2-Q1O19441 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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H2-Q1O19441 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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H2-Q1O19441 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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H2-Q1O19441 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
H2-Q1O19441 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms