Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec22bO08547 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms