Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8356J3QPD3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms