Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc6D3YZP9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms