Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Spocd1B1ASB6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Spocd1B1ASB6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms