Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Trpc2Q9R244 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trpc2Q9R244 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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