Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm14862-201ENSMUST00000115553 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm38283-201ENSMUST00000193041 695 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gpc1Q9QZF2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms