Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms