Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ldb3Q9JKS4 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms