Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Clstn2Q9ER65 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms