Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hmg20aQ9DC33 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hmg20aQ9DC33 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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