Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SrpraQ9DBG7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SrpraQ9DBG7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms