Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Chmp4cQ9D7F7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Chmp4cQ9D7F7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Chmp4cQ9D7F7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Chmp4cQ9D7F7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Chmp4cQ9D7F7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Chmp4cQ9D7F7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Chmp4cQ9D7F7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Chmp4cQ9D7F7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp4cQ9D7F7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Chmp4cQ9D7F7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp4cQ9D7F7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chmp4cQ9D7F7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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