Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pfn4Q9D6I3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pfn4Q9D6I3 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms