Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Syf2Q9D198 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Syf2Q9D198 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms