Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Q9CWU4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Q9CWU4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms