Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Atg12Q9CQY1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg12Q9CQY1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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