Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NsmfQ99NF2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms