Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubqln4Q99NB8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubqln4Q99NB8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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