Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp1b4Q99ME6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp1b4Q99ME6 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms