Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ppargc1bQ8VHJ7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms