Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ubxn4Q8VCH8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms