Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
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Hoxc12Q8K5B8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxc12Q8K5B8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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