Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

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Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gtf3c1Q8K284 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gtf3c1Q8K284 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gtf3c1Q8K284 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gtf3c1Q8K284 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gtf3c1Q8K284 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Gtf3c1Q8K284 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gtf3c1Q8K284 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms