Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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FgbQ8K0E8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
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FgbQ8K0E8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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FgbQ8K0E8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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FgbQ8K0E8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
FgbQ8K0E8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
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FgbQ8K0E8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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FgbQ8K0E8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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FgbQ8K0E8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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FgbQ8K0E8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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FgbQ8K0E8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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FgbQ8K0E8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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