Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp38Q8BW70 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp38Q8BW70 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp38Q8BW70 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp38Q8BW70 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp38Q8BW70 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp38Q8BW70 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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