Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usp1Q8BJQ2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usp1Q8BJQ2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp1Q8BJQ2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp1Q8BJQ2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usp1Q8BJQ2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp1Q8BJQ2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Usp1Q8BJQ2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms