Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Htatsf1Q8BGC0 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Htatsf1Q8BGC0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Htatsf1Q8BGC0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Htatsf1Q8BGC0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Htatsf1Q8BGC0 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Htatsf1Q8BGC0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htatsf1Q8BGC0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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