Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Zbed4Q80WQ9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms