Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rims3Q80U57 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms