Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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