Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mfsd13aQ6PDE8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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