Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PtprjQ64455 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms