Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Taf6Q62311 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Taf6Q62311 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Taf6Q62311 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Taf6Q62311 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Taf6Q62311 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Taf6Q62311 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Taf6Q62311 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Taf6Q62311 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Taf6Q62311 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms