Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Xrcc1Q60596 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Xrcc1Q60596 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Xrcc1Q60596 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Xrcc1Q60596 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Xrcc1Q60596 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Xrcc1Q60596 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Xrcc1Q60596 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Xrcc1Q60596 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Xrcc1Q60596 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Xrcc1Q60596 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Xrcc1Q60596 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms