Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim58Q5NCC9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms