Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ankrd53Q3V0J4 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms