Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm28047Q3US59 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms