Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem35bQ3U0Y2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms