Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fndc4Q3TR08 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms