Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Defa26Q3L180 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Defa26Q3L180 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Defa26Q3L180 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Defa26Q3L180 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Defa26Q3L180 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa26Q3L180 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms