Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rtl9Q32KG4 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rtl9Q32KG4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms