Protein–RNA interactions for Protein: Q307W7

Kncn, Kinocilin, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KncnQ307W7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KncnQ307W7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
KncnQ307W7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KncnQ307W7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KncnQ307W7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KncnQ307W7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KncnQ307W7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KncnQ307W7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KncnQ307W7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
KncnQ307W7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KncnQ307W7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KncnQ307W7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KncnQ307W7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
KncnQ307W7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
KncnQ307W7 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms