Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trim71Q1PSW8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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