Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpusd3Q14AI6 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms