Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah1bQ06985 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms