Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Thbs3Q05895 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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