Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Nf1Q04690 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms