Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col1a2Q01149 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms